Музей истории изучения вечной мерзлоты официально организован в 2006 году в Якутске при Институте мерзлотоведения им. П. И. Мельникова СО РАН. В качестве ведомственного музея он выполняет научно-просветительскую и образовательную функции, имеет естественно-научный, научно-технический и историко-культурный профили. С самого начала работы института, его сотрудники считали своим долгом популяризировать науку, читая просветительские лекции для населения, печатая информационные статьи в местных газетах и центральных журналах, проведя экскурсию по рабочим площадям института, в том числе и в подземной лаборатории института, построенной в 1940-х годах.
Продолжая традиции, заложенные корифеями науки мерзлотоведения, в институте функционирует экскурсионно-лекторская группа из высококвалифицированных сотрудников, которые проводят для широких слоев населения научно-популярные лекции по вопросам мерзлотоведения с показом слайдов и документальных фильмов в ходе научно-познавательной экскурсии.
Специально разработанный для этого научным коллективом института туристский продукт «Уникальный маршрут в толщу вечной мерзлоты» стал одним из самых успешных туристических проектов в Якутии. Он включает несколько уникальных культурных и научно-исследовательских объектов института:
- «Шахта Шергина» – объект культурного наследия федерального уровня. Утвержден Приказом Министерства культуры РФ от 27 сентября 2017 г. №1631 (номер в реестре ОКН 141711076350005);
- подземная геокриологическая лаборатория, функционирующая с 1967 года. Здесь демонстрируются мёрзлые толщи, возраст которых около 10 000 лет, остатки древней флоры и фауны криолитозоны, научное оборудование для проведения мерзлотно-геологических изысканий. Подземная лаборатория состоит из двух галерей и нескольких помещений, находящихся на разных глубинах – от 4 до 15 м. Общая площадь подземной части музея составляет более 300 кв. м;
- экспозиционно-выставочный зал музея, расположенный в лабораторном корпусе института. Его площадь составляет 150 кв. м (большой зал и две комнаты). Основные экспонаты размещены в большом зале. В одной из комнат с большой точностью воссоздан рабочий кабинет основателя института академика П. И. Мельникова.
- памятники ИМЗ СО РАН – памятник академику П. И. Мельникову, имя которого присвоено Институту мерзлотоведения (установлен 5 августа 2011 г. в сквере перед зданием института), и скульптура «Мамонт», являющаяся неофициальным символом города Якутска – самого крупного города, построенного на вечной мерзлоте (сооружен в 1971-1972 гг. Л.Г. Адониным, А.С. Кульбацким, Р.С. Гаврильевой);
- федеральное криохранилище семян растений, построенное в 2012 г. по энергосберегающей технологии, разработанной в ИМЗ СО РАН.
Ежегодно музеем проводится более 300 экскурсий, с общим количеством экскурсантов более 2000 человек. В некотором смысле музей является образовательной площадкой для школьников и студентов. В институте работает ШНО (школьное научное объединение) «Геокриолог». Здесь научные сотрудники шефствуют над школьниками: проводят лекции, экскурсии, руководят научными исследованиями, готовят к выступлению на конференциях.
Музей участвует в проведении тематических выставок как на своей площадке, так и на площадках других музеев, а также принимает активное участие в выездных мероприятиях: выставках, фестивалях и т.д.